ทะเลสาบวากาติปูเป็นทะเลสาบที่ใหญ่เป็นอันดับสองในเขตทะเลสาบใต้ ครอบคลุมพื้นที่ 290 ตารางกิโลเมตร ทะเลสาบวากาติปูกว้างที่สุด 5 กิโลเมตร และมีความยาวรวม 84 กม. ในช่วงยุคน้ําแข็งสุดท้าย ธารน้ําแข็งขนาดใหญ่ที่เคลื่อนจากตะวันตกเฉียงเหนือแกะสลักสิ่งที่ตอนนี้คือทะเลสาบวากาติปู