เมืองนากซอสตั้งอยู่บนชายฝั่งตะวันตกของเกาะที่มีชื่อเดียวกัน เป็นเมืองหลวงและเมืองที่ใหญ่ที่สุดของที่นี่ โดยมีเรือแล่นเชื่อมต่อไปยังทุกส่วนของกรีซและเกาะอื่นๆ โดยรอบ ในอดีตเคยเป็นนครรัฐสำคัญที่ชาวกรีกและชาวคาธอลิกในเวนิสอาศัยอยู่ร่วมกัน ปัจจุบัน นครรัฐแห่งนี้กลายเป็นจุดหมายปลายทางด้านการท่องเที่ยวในภูมิภาคอีเจียน และมักมีนักท่องเที่ยวหนาแน่นทุกฤดูร้อน